Rund um Himmelsthür gibt es insgesamt sechs Naturschutzgebiete (NSG). Der gesamte Landschaftskomplex wurde von der Europäischen Kommission in das Schutzgebietssystem „Natura 2000“ aufgenommen und als FFH-Gebiet 115 „Haseder Busch, Giesener Berge, Gallberg, Finkenberg“ ausgewiesen, das dem besonderen Schutz von Pflanzen (Flora), Tieren (Fauna) und Lebensräumen (Habitaten) dient. In der südlichen Gemarkung Himmelsthürs befinden sich die Naturschutzgebiete „Gallberg“ und „Finkenberg/Lerchenberg“, im Norden „Lange Dreisch und Osterberg“, „Giesener Teiche“, „Haseder Busch“ sowie „Mastberg und Innersteaue“. Die vier nördlichen sind von der Stadt Hildesheim als Naturerlebnisgebiet „Kleeblatt“ zusammengefasst worden, im Süden wurde in Kooperation mit dem Gymnasium Himmelsthür der Naturerlebnispfad „Gallberg“ erschlossen.
